全新LC100液相色譜系統配備的WS-100工作站軟件不同于了以往傳統的模擬信號工作站，除了能夠采集數據及處理數據意外，還能夠全面反控儀器的各項配置，實現系統的全自動一體化。
　　1 . 梯度洗脫：用戶只需在相應列表中輸入各種流動相的配比，流量及其變化時間，就可輕松準確的實現梯度洗脫的操作。另外軟件還提供了相應的泵流量曲線，以便于用戶校對梯度設置，并使用戶能夠更直觀的了解梯度運行的進程。
　　2 . 光譜掃描：為了測試氘燈，軟件提供了光譜掃描的功能。首先用戶可直觀的檢測到不同波長下氘燈光強的大小，并可據此判斷是否需要更換氘燈。其次還可以通過圖譜上486.6nm和656nm這二點的位置，以判斷波長示值誤差的準確性。
　　3 . 波長掃描：軟件所提供的波長掃描功能其范圍在180—680nm之間，zui小步長為1nm，它能夠幫助用戶清楚的了解到樣品對不同波長紫外光的吸收度，以便用戶針對不同樣品采用不同的檢測波長來達到*的分析效果。。
　　4 . 事件繼電器：采用了時間程序控制的事件繼電器，可以實現各種用戶所需的功能，如切換轉向閥實現分離回收流動相等。這些功能現流行的工作站都無法實現。